WEKO3
アイテム
Identification of differentially expressed gene modules between two-class DNA microarray data
http://hdl.handle.net/10258/0002000053
http://hdl.handle.net/10258/0002000053369fe425-c925-4922-8491-24a95bad143c
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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| アイテムタイプ | 学術雑誌論文 / Journal Article.(1) | |||||||||||||||
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| 公開日 | 2023-09-28 | |||||||||||||||
| 書誌情報 |
en : Bioinformation 巻 4, 号 4, p. 134-137, ページ数 4, 発行日 2009-10-11 |
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| タイトル | ||||||||||||||||
| タイトル | Identification of differentially expressed gene modules between two-class DNA microarray data | |||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||
| 主題 | DNA | |||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||
| 主題 | microarray | |||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||
| 主題 | gene expression | |||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||
| 主題 | two-class | |||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||
| 資源タイプ | journal article | |||||||||||||||
| 著者 |
岡田, 吉史
× 岡田, 吉史
× 井上, 皓文
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| 抄録 | ||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||
| 内容記述 | Identifying biologically useful genes from massive gene expression data is a critical issue in DNA microarray data analysis. Recent studies on gene module discovery have shown a substantial effect on identifying transcriptional regulatory networks involved in complex diseases for different sample subsets. These have targeted a single disease class, but discovering discriminative modules in different classes has remained to be addressed. In this paper, we propose a novel method that can discover differentially expressed gene modules from two-class DNA microarray data. The proposed method is applied to breast cancer and leukemia datasets, and the biological functions of the extracted modules are evaluated by functional enrichment analysis. As a result, we show that our method can extract genes well reflecting known biological functions compared to a traditional t-test-based approach. | |||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||||
| 出版者 | Biomedical Informatics | |||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||
| 出版者版へのリンク | ||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||
| 表示名 | 10.6026/97320630004134 | |||||||||||||||
| URL | https://doi.org/10.6026/97320630004134 | |||||||||||||||
| DOI | ||||||||||||||||
| 関連タイプ | isIdenticalTo | |||||||||||||||
| 識別子タイプ | DOI | |||||||||||||||
| 関連識別子 | 10.6026/97320630004134 | |||||||||||||||
| PMID | ||||||||||||||||
| 関連タイプ | isIdenticalTo | |||||||||||||||
| 識別子タイプ | PMID | |||||||||||||||
| 関連識別子 | 20198188 | |||||||||||||||
| ISSN | ||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | PISSN | |||||||||||||||
| 収録物識別子 | 0973-8894 | |||||||||||||||
| ISSN | ||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | EISSN | |||||||||||||||
| 収録物識別子 | 0973-2063 | |||||||||||||||
| 権利 | ||||||||||||||||
| 権利情報 | © 2009 Biomedical Informatics | |||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||
| 著者版フラグ | ||||||||||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||||||||